Дык деньги-то у гордумы в обоих вариантах, так что в этом плане как раз совсем без разницы.
Там, собственно, существенных в моем понимании моментов два: у сити-менеджера голова не болит о следующих выборах, а значит, он может больше сил тратить на собственно управление коммунхозом; с другой стороны, мэр из-за предстоящих вынужден куда больше оглядываться на избирателя, что не всегда хорошо. Второе то, что выгнать сити-менеджера много проще, чем мэра, что опять же палка о двух концах. Впрочем, о вечности думать не будут оба: у первого нет гарантий, что новый горсовет его наймет, а второму надо давать максимум два срока, иначе точно заворуется.
В теории это вопрос о том, нужно ли муниципальную власть делить на исполнительную и законодательную. Наверное, где-то нужно, где-то нет, где именно - тема для докторской. А поскольку докторской пока, кажется, нет, можно и волюнтаризмом позаниматься.
В целом же, имхо, хрень несусветная. В Кремле кто-то кому-то решил лизнуть ж, ну и понеслось.